Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms