Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms