Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPN7

1810009J06Rik, RIKEN cDNA 1810009J06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810009J06RikQ9CPN7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1810009J06RikQ9CPN7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1810009J06RikQ9CPN7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1810009J06RikQ9CPN7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1810009J06RikQ9CPN7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1810009J06RikQ9CPN7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1810009J06RikQ9CPN7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1810009J06RikQ9CPN7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1810009J06RikQ9CPN7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1810009J06RikQ9CPN7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1810009J06RikQ9CPN7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1810009J06RikQ9CPN7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1810009J06RikQ9CPN7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1810009J06RikQ9CPN7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1810009J06RikQ9CPN7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1810009J06RikQ9CPN7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1810009J06RikQ9CPN7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1810009J06RikQ9CPN7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1810009J06RikQ9CPN7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1810009J06RikQ9CPN7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1810009J06RikQ9CPN7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1810009J06RikQ9CPN7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1810009J06RikQ9CPN7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1810009J06RikQ9CPN7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1810009J06RikQ9CPN7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1810009J06RikQ9CPN7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1810009J06RikQ9CPN7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1810009J06RikQ9CPN7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1810009J06RikQ9CPN7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1810009J06RikQ9CPN7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1810009J06RikQ9CPN7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms