Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms