Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms