Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep41Q99NF3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep41Q99NF3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms