Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms