Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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