Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pcgf6Q99NA9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms