Protein–RNA interactions for Protein: Q99N84

Mrps18b, 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps18bQ99N84 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Mrps18bQ99N84 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrps18bQ99N84 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms