Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms