Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms