Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms