Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms