Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms