Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pagr1aQ99L02 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms