Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms