Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atg5Q99J83 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atg5Q99J83 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atg5Q99J83 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atg5Q99J83 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atg5Q99J83 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atg5Q99J83 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atg5Q99J83 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atg5Q99J83 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atg5Q99J83 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms