Protein–RNA interactions for Protein: Q99J36

Thumpd1, THUMP domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd1Q99J36 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thumpd1Q99J36 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thumpd1Q99J36 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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