Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms