Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf144aQ925F3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms