Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms