Protein–RNA interactions for Protein: Q922Q2

Riok1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok1Q922Q2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Riok1Q922Q2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Riok1Q922Q2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Riok1Q922Q2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Riok1Q922Q2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Riok1Q922Q2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Riok1Q922Q2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Riok1Q922Q2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Riok1Q922Q2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Riok1Q922Q2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Riok1Q922Q2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Riok1Q922Q2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Riok1Q922Q2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Riok1Q922Q2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms