Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms