Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms