Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Basp1Q91XV3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Basp1Q91XV3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Basp1Q91XV3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Basp1Q91XV3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Basp1Q91XV3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms