Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms