Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms