Protein–RNA interactions for Protein: Q91W92

Cdc42ep1, Cdc42 effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep1Q91W92 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep1Q91W92 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep1Q91W92 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep1Q91W92 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep1Q91W92 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep1Q91W92 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep1Q91W92 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep1Q91W92 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep1Q91W92 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep1Q91W92 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep1Q91W92 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep1Q91W92 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdc42ep1Q91W92 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep1Q91W92 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms