Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd3Q91W18 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd3Q91W18 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms