Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ApofQ91V80 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms