Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cabp4Q8VHC5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabp4Q8VHC5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms