Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dkk4Q8VEJ3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dkk4Q8VEJ3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dkk4Q8VEJ3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dkk4Q8VEJ3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dkk4Q8VEJ3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms