Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Smg8Q8VE18 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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