Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms