Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms