Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim29Q8R2Q0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim29Q8R2Q0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim29Q8R2Q0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim29Q8R2Q0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim29Q8R2Q0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim29Q8R2Q0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim29Q8R2Q0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim29Q8R2Q0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim29Q8R2Q0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim29Q8R2Q0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim29Q8R2Q0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim29Q8R2Q0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim29Q8R2Q0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim29Q8R2Q0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim29Q8R2Q0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim29Q8R2Q0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim29Q8R2Q0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim29Q8R2Q0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim29Q8R2Q0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim29Q8R2Q0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim29Q8R2Q0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim29Q8R2Q0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim29Q8R2Q0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim29Q8R2Q0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim29Q8R2Q0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim29Q8R2Q0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim29Q8R2Q0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trim29Q8R2Q0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trim29Q8R2Q0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trim29Q8R2Q0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms