Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

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Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Impg1Q8R1W8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Impg1Q8R1W8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Impg1Q8R1W8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Impg1Q8R1W8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Impg1Q8R1W8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Impg1Q8R1W8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Impg1Q8R1W8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Impg1Q8R1W8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms