Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5C8

Rdh9, Cis-retinol/androgen dehydrogenase type 3, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh9Q8K5C8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh9Q8K5C8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms