Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms