Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot6Q8K3P5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot6Q8K3P5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot6Q8K3P5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot6Q8K3P5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot6Q8K3P5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot6Q8K3P5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot6Q8K3P5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot6Q8K3P5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot6Q8K3P5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot6Q8K3P5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot6Q8K3P5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot6Q8K3P5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot6Q8K3P5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot6Q8K3P5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot6Q8K3P5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot6Q8K3P5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot6Q8K3P5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot6Q8K3P5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot6Q8K3P5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot6Q8K3P5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot6Q8K3P5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot6Q8K3P5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot6Q8K3P5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot6Q8K3P5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot6Q8K3P5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot6Q8K3P5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms