Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms