Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms