Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms