Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Abcf3Q8K268 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms