Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms