Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sde2Q8K1J5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms