Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms