Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D5

Gfm1, Elongation factor G, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfm1Q8K0D5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfm1Q8K0D5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfm1Q8K0D5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfm1Q8K0D5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfm1Q8K0D5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfm1Q8K0D5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfm1Q8K0D5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfm1Q8K0D5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfm1Q8K0D5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfm1Q8K0D5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfm1Q8K0D5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfm1Q8K0D5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfm1Q8K0D5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfm1Q8K0D5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfm1Q8K0D5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gfm1Q8K0D5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gfm1Q8K0D5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gfm1Q8K0D5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gfm1Q8K0D5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfm1Q8K0D5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms