Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms